Dana 19. studenog 2012. godine održana je prva sjednica Koordinacijskog povjerenstva na kojoj je usvojen Poslovnik o radu Koordinacijskog povjerenstva te prijedlog uspostave Tematskih radnih skupina. Tehničkim tajništvom Koordinacijskog povjerenstva imenovan je Sektor za koordinaciju fondova Europske unije u sklopu Uprave za strateško planiranje Ministarstva regionalnoga razvoja i fondova Europske unije kao organizacijska podrška pravilnom i učinkovitom radu Koordinacijskog povjerenstva. Na istoj sjednici Uprava za strateško planiranje u Ministarstvu regionalnoga razvoja i fondova Europske unije imenovana je tijelom odgovornim za koordinaciju programiranja. Također, dogovoreni su daljnji koraci i zadaci Koordinacijskog povjerenstva, formiranje i početak rada Tematskih radnih skupina te je osobito naglašena važnost pripreme kvalitetnih dokumenata i projekata kako bi se osiguralo učinkovito korištenje sredstava koja će biti na raspolaganju Republici Hrvatskoj iz europskih fondova.