Prioritet ulaganja 2: Poticanje energetske učinkovitosti, obnovljivih izvora energije i zaštite prirodnih resursa

Unutar ovog prioriteta najviša financijska ulaganja bit će usmjerena u sustav vodoopskrbe i pročišćavanja  otpadnih voda kako bi se ispunile obveze i rokovi koji proizlaze iz Pristupnog ugovora EU. Velike investicije predviđene su i za uspostavu cjelovitog sustava gospodarenja otpadom koji uključuje izgradnju novih centara za gospodarenje otpadom te sanaciju postojećih odlagališta.

Ujedno se planiraju ulaganja u zaštitu i očuvanje biološke raznolikosti, promicanje ekosustavnih usluga te osiguravanje upravljanja područjima ekološke mreže NATURA 2000. Predviđene aktivnosti uključuju i razminiranje, kao preduvjet za provedbu pojedinih projekata.

Nadalje, tematski cilj 6. uključuje aktivnosti u području kulturne baštine kojima bi se potaknuo gospodarski razvoj i poboljšala konkurentnost osobito slabije razvijenih regija.